2019-nCoV N蛋白在新冠诊断中的应用——擒贼先擒王351
发表时间:2020-02-21 00:00
2019-nCoV,或者,也许我们现在可以叫其SARS-CoV-2(SARS二号),其S蛋白与SARS同源性大约75%(S1同源性68%,S2同源性94),N蛋白同源性94%。前事不忘,后事之师,因此我们先来回顾一下当年对付SARS,前辈们到底留下了什么线索。 大量文献表明,由于N蛋白的免疫原性较强且产量很大,因此N蛋白抗体在SARS病人体内存在时间较长,其丰度亦远高于抗S蛋白的抗体 (Journal of Virological Methods 127 (2005) 46–53)。另有文献表明,在早期阶段检测SARS-CoV N蛋白比检测病毒RNA和特异性抗体更为灵敏。SARS患者血清样本中的N蛋白最早可在感染后第1天被检测到(图1)。感染前10天内血清样品中N蛋白的阳性检出率高于RT-PCR检测的阳性率。此外,一项在感染早期检测SARS-CoV特异性IgG,SARS-CoV RNA和N蛋白的比较研究表明,N蛋白的检测效率明显高于其他两个标志物。我们找到了一篇有趣的文章,该文作者让N和S来了场面对面的PK,结果半斤八两(图2)。
图1 N蛋白及其抗体在SARS患者体内检出率随时间变化趋势
图2 基于N蛋白和S蛋白的SARS病毒检测方法PK 另有文献报道,SARS-CoV全长N蛋白会与健康人或感染其他冠状病毒的病人血清交叉反应,由于N蛋白的高同源性,推测2019-nCoV N全长蛋白亦可能有此现象,因此特异性可能会有一定问题。为了降低非特异,可选用截短的N蛋白。与基于全长N蛋白的ELISA相比,截短型蛋白的ELISA对SARS-CoV抗体的检测更具特异性和敏感性。根据对SARS-CoV的文献调研,我们设计了5种截短的N蛋白(2020T7、2020T7a、2020T7b、2020T7c、2020T7d,不过后两种还没做完,敬请期待),理论上可在不降低灵敏度的前提下降低这种交叉反应。另外,也有文献报道SARS-CoV全长N蛋白容易断裂形成26kD左右的片段,我们发现2019-nCov N蛋白也有这种现象,通过分析序列设计了一种全长N蛋白突变体可以避免断裂,为检测提供更多选择(2020T6a)。 百新意团队通过不懈的努力,日前已获得了特异性human anti-2019-nCoV NP mAb(当然我们也有抗S的抗体),并用该抗体对上述原料进行了检测,发现该抗体特异性可结合全长N蛋白(亦包括突变型N蛋白)和N端片段(N1,N2),而不结合N蛋白的C端片段。
图3 用特异性抗N蛋白抗体检测N全长和N片段蛋白(图比较丑,但真实啊,没空好好做了,大家多包涵) 总结下,N蛋白很重要,不要因为它不好做就轻易放弃。几点提示如下:(1)N蛋白不好金标,因此最好用于包被(2)N全长蛋白很不稳定,我们做ELISA发现37度1小时效果比4度过夜信号值低不少(3)N片段的非特异更低,可尝试单独使用或组合使用,甚至与S、M等蛋白联用。以下是N蛋白相关产品的信息,欢迎致电垂询,刘老师最喜欢讨论技术问题了。 还是那句话,有问题请咨询刘老师。
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