解惑:该如何对待脆弱的SARS-CoV2 N蛋白?134
发表时间:2020-06-21 14:11
千锤百炼,精益求精!
今天刘老师和大家唠唠SARS-CoV2 N蛋白那点事。 过去的5个月,IVD圈对新冠抗体检测的认识不断的加深。一开始,大家全搞N抗体检测,为啥呢?因为N蛋白好做啊!原核表达,产量、纯度也还不错,再加上N蛋白在病毒内丰度本身就很高,这不是完美的biomarker嘛!然而,事与愿违,大家伙一做,发现N蛋白全是坑啊!然后,众所周知的,大家都去搞RBD了。再然后,大伙又发现,不加N还是不成,漏检太厉害。所以,今天咱就好好说说N蛋白的坑。 1号坑:关于N蛋白的浓度——你以为你以为的就是你以为的吗? 自己做过N蛋白表达的都知道,N蛋白的表达量,那看着是贼高啊!轻轻松松的几百mg/L的产量。但是如果你去用BCA做个定量,你一定会发现得出的浓度和OD280算出来的差老多了,这是为毛啊? 别慌,您去看看您的OD260/280, 是不是远远高于0.57(純蛋白的比值)了? 一般而言,对于N蛋白,您什么处理都不做,直接这么纯化,得到的OD260/280一般都在1.0以上。那这是为什么呢?其实道理很简单,N蛋白是核蛋白,本来就是结合RNA的,所以呢,纯化过程中很可能缠绕着大量的核酸(RNA和DNA)。这样,我们的得到的其实并不是純蛋白,而是N蛋白与核酸的复合物。N蛋白上带着核酸,这不仅会影响N蛋白的纯度,更重要的是,核酸会干扰N蛋白与抗体的结合,因此会影响灵敏度或特异性。 总之,要想纯化的到純的N蛋白,还是需要下一番功夫的。听到这,市场上200/mg的N蛋白,您还敢买吗?记住,要想选一个基本合格的N蛋白(注意,仅仅是最低要求,基本合格而已),您不仅要看供应商提供的SDS-PAGE,更要自己测测OD260/280,如果这个数大于0.7了,那就退货吧。
2号坑:关于N蛋白的稳定性——颜值不够,化妆来凑! 废话不多讲,N蛋白,自身稳定性非常的差。 那差到什么程度呢? 差到……(1)制剂里必须要加高盐(>150mM NaCl)还不能冻-20或者-80,不然必然沉淀!(2)你冻起来吧,它沉淀;不冻起来吧,它会降解——且是不可抑制的自水解! 这就麻烦了,一个蛋白这么不稳定,那怎么用啊? 莫慌,经过5个月的不懈努力,百新意N抗原历经4代22种,终于筛选出了最佳品种——NX(2020T7X)。该抗原不仅金标简单稳定,特异性灵敏度优异,且特异性奇佳(>99%)。近期,NX制剂配方升级后可长期保存在-80,-20,且反复冻融不会产生沉淀(看下图的对比,制剂过后的NX,及时经过-80反复冻融,依然清澈如许啊!)。4度保存2个月其品质亦完好如初。
左:未制剂NX-80冻存24小时 中: 0.3%添加剂NX--80冻存24小时右1%添加剂NX--80冻存24小时 划重点,凡是说自己的N蛋白不放盐的,要么是骗子,要么卖假货!
3号坑:关于N蛋白的非特异——与生俱来,但并非无药可治! 抛开外在因素不提,根据17年前科学家们对SARS N蛋白的研究,新冠N蛋白的非特异主要来源于其N端。 所以,干掉N端,就去掉了一大半非特异。 但是,仅仅留下C端,这么小的蛋白,可不好用啊。 所以,百新意就创造了NX——C端融合蛋白。该蛋白不仅灵敏度高,且非特异极低(下图有真相)。
上:NX特异性与灵敏度检测 下左:NX特异性检测 下右:NX的SDS-PAGE 4号坑:关于N蛋白的金标条件——NX它不香吗? N蛋白金标有点困难。首先,N蛋白表面分布着几十个Lys,这给金标带来了比较大的麻烦。
左:N蛋白N端结构域 右:N蛋白C端结构域 黄色的毛毛虫样的分子是Lys 其次,前面咱们讲到了,N蛋白制剂,必须要放盐,而这无疑是给本就不好标记的N蛋白雪上加霜。
N蛋白可得多撒点盐 那,这咋整啊? 莫慌,接下来公布答案。 第一,要选百新意的NX。这不是广告,这很重要! NX 是一个经过优化的N蛋白,其不仅保留了N全长的蛋白的灵敏,还极大消除了N蛋白的非特异,更重要的是,这个蛋白很容易金标啊! 第二, 标记条件和标记结果,看下面这图应该就明白了吧。下边打印的数字,是指1ml金标体系中,加多少0.2M的K2CO3。
NX的金标条件与金标效果 总结一下,NX具有(1)特异性极好(2)灵敏度高(3)稳定(4)易于金标等四大优势。百新意的NX产能充足(周产能6-10g),质量稳定,目前已供给多家大型企业的层析和发光生产线。
百新意新冠抗体检测搭配 捕获(三线条)法与间接法——NX(2020T7X)+RBD his(2020T4) 双抗原夹心法:RBD his(2020T4)金标+RBD-hFc(2020T4h) 百新意新冠产品列表
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