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强悍:不受突变株影响的新冠N抗体配对 ——你且千变万化,我有火眼金睛

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发表时间:2021-05-21 20:58

强悍:不受突变株影响的新冠N抗体配对

——你且千变万化,我有火眼金睛

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众所周知SARS-CoV-2是一种RNA病毒其基因组在复制过程中缺少纠错机制因而比较容易产生突变。随着疫情的进展,全球已累计感染了超过1.6亿人据估计实际感染人数应该远高于此。一个较高的突变率乘以巨大的感染人数,这显然提高了突变的概率。到目前为止,已鉴定出VOCVariant of concern: variants for which there is evidence of an increase in transmissibility, more severe disease and or escape of neutralization by antibodies)突变5株,VOIVariant of Interest: variants with specific genetic markers that have been associated with changes that may impact public health.)突变11株。其中,有我们既有我们耳熟能详的英国(B.1.1.7)、南非(B.1.351)、巴西(P.1)突变株,更有最近令人闻风丧胆的印度突变株(B.1.617)。

由于N蛋白在病毒内含量较高,因此各家的抗原检测试剂均是以N蛋白为标志物进行开发的。与2019年底开始流行的野生型相比上述突变株S-RBD都发生了较大的变化见下表,数据来源https://viralzone.expasy.org/9556)。除此以外,其NMEorfab1等基因也发生了诸多变化以目前流行趋势最猛的印度突变株(B.1.617)为例,除了在RBD上出现了L452RE484Q双突变外,其N基因也带有D377YR203M双突变。这些突变株的出现,显然会引起新冠抗原检测试剂厂家的担忧——这些突变点会不会正好落在自己的抗体配对内?这些突变究竟会对自己试剂的灵敏度产生什么样的影响?自己公司的试剂是不是可以检测出突变型病毒?

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   百新意近期推出的N配对抗体BN07及其改进型BN12BN12BN07的突变体,表位一致)/BN08表现惊艳已被国内十几家大中型IVD公司选为生产原料(具体内容参见《后浪来了——新冠N抗原检测配对抗体“火眼”(BN07)和“金睛”(BN08)问世》《百新意新冠N抗原检测配对抗体测评结果》)。在前期筛选过程中,我们已经验证了BN08的表位位于1-40位氨基酸之间BN07/BN12的表位则位于30-120位之间ELISA图)。可见,上述突变列表中,仅有英国株B.1.1.7D3L和巴西株P.1P80R两个突变点在BN07BN08的范围内。因此我们推测,BN07/BN12BN08的配对不会受到目前已知的大部分VOCVOI突变株的影响。至于D3LP80R两个突变,根据经验来看这两种氨基酸一般不易出现在抗原抗体结合表位上。

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   为了验证我们的推测,百新意研发团队构建了以下突变型N蛋白:包括T205I (对应B.1.351B.1.427B.1.429B.1.214.2P80R(对应P.1单突变,及D3L/S235F(对应B.1.1.7D377Y/R203M(对应B.1.617,即印度株)双突变株。如下图可见,由BN07/BN11/BN12BN08配对组成的金标试纸条对野生型及各种突变型N蛋白的检出限完全一致,因此说明目前已知的突变点对我们的配对均无影响,大家尽可放心使用!

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   综上所述,BN07/BN12BN08组成的配对不仅灵敏度登峰造极而且还可用来检测目前全部的突变株而不受到其N蛋白突变的影响。这么好的配对,您还不换吗?退一步讲,如果您坚持不换,那至少应该用突变型N蛋白,测测自己的配对受不受影响吧?


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咬定青山不放松立根原在破岩中

千磨万击还坚劲,任尔东西南北风。


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